অত্র এলাকায় আনুমানিক ৩০০ বৎসর পূর্বে জনবসতি শুরু হয়। আনুমানিক ১৫০/২০০ বৎসর পূর্বে অত্র এলাকার হিন্দু সম্প্রদায়ের লোকেরা পুরো চৈত্র মাস শিবাসন বা পাট মাথায় নিয়ে এলাকায় ধর্মীয় জাগ-যজ্ঞাদি ও গান বাজনা করে মাসের শেষে চৈত্র সংক্রান্তিতে পাট পূঁজা বা নিল পূঁজা করতেন। সেই পাট পূঁজা থেকে অত্র এলাকার নাম হয় পাটগাতী গ্রাম। পরবর্তিতে পাটগাতী গ্রামের নাম অনুসারে এই ইউনিয়নের নাম হয় পাটগাতী। (অনুমান ১৮৯০-১৯০০)। ১৯০০ হতে ১৯৪৭ পর্যন্ত পাটগাতী ইউনিয়ন বোর্ড নামে পরিচিত ছিল। ১৯৪৭ হতে ১৯৭১ পর্যন্ত ইউনিয়ন কাউন্সিল নামে পরিচিত ছিল। বাংলাদেশ স্বাধীনের পরে ১৯৭৩ সালে পাটগাতী ইউনিয়ন পরিষদ নাম হয়।